目前，胚胎冷冻技术作为生育保存的方法已较为成熟。试管婴儿除了前期胚胎发育在体外，其他和自然受孕没有任何区别。《新英格兰》杂志2012年发表了一篇大样本研究。该研究统计了南澳大利亚州308974名(含6163名辅助生育技术)出生孩子的健康状况。去除了父母本身的影响因素后，体外受精(IVF，俗称第一代试管婴儿)子代出生缺陷风险与自然妊娠相似;卵母细胞单精子注射(ICSI，俗称第二代试管婴儿)鲜胚移植周期子代出生缺陷风险较自然妊娠略增加，但冻胚移植周期子代出生缺陷的风险没有增加。
这是由于控制性超促排卵后，子宫内膜上的雌二醇和孕酮的受体表达明显改变，使子宫内膜发育明显提前，降低胚胎着床子宫的概率，因此，新鲜胚胎移植较冷冻胚胎移植临床妊娠率低。其次，在冷冻-复苏过程中，优质胚胎与异常胚胎的差距越来越明显，异常的胚胎将会被淘汰，降低了胎儿的出生缺陷。而且冻胚移植可以选择合适的周期，相比于鲜胚移植，提高了妊娠率。
部分研究表明，采用冻融胚胎移植出生的新生儿其低体重率、孕妇产前出血的概率、围产儿早产、死亡率等均比新鲜移植胚胎要明显降低。但是，冷冻胚胎主要针对试管婴儿的不孕夫妇，一般不作为正常人保存生育功能的手段。有临床试验证明过：冻胚移植和自然受孕还有鲜胚移植的新生儿相比较，三组宝宝的听说能力没有差异, 神经系统的发育上面也是没有差异的。在冷冻胚胎后代的健康问题上，根据国内外的长期随访可见，冷冻胚胎出生的孩子，其生长发育情况和健康状况及免疫力水平等均与新鲜胚胎的出生孩子无明显的差异，在体格及智力上也并不存在劣势。
因此，冷冻胚胎仍旧不可以取代新鲜胚胎，到目前为止，采用胚胎冷冻技术出生的人也就刚过不惑之年，其安全性还需要更长的时间来随访验证！目前使用的冷冻方法均能够最大化的减少对细胞的损伤，并且保证细胞的存活。胚胎冷冻技术通常采用玻璃化冷冻法，它可以极大程度避免细胞内冰晶的产生，因此胚胎在复苏后绝大部分可以完整地存活。
有研究表明，冷冻胚胎与新鲜胚胎相比，其胚胎移植过程中在子宫内的着床能力是相近的。由此可见，经过冷冻的胚胎或者囊胚，依然有很大概率可以存活、着床，并发育成健康的胎儿。同时，对于细胞进行冷冻，在理论上并不会改变细胞内的遗传物质。
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