对于免疫性不孕症的诊断仍未明确，主要是研究抗精子抗体、抗卵巢抗体、抗子宫内膜抗体等抗体对生殖的影响。近年来，研究者们把焦点放在同种免疫上，如外周血免疫细胞及子宫内膜微环境改变等对生殖的影响，但不论是自身抗体还是同种免疫对生殖的影响目前都在研究阶段，暂无定论。因此，是否能够根据自身抗体阳性或同种免疫的异常来作出免疫性不孕
症的诊断也是值得深思和进一步探讨的。
针对配子和器官的抗体针对配子和器官的抗体主要包括抗精子抗体、抗卵巢抗体、抗子宫内膜抗体和抗甲状腺抗体等。之前有研究认为这些抗体可能会影响女性生殖，但有分析表明，抗精子抗体与体外受精－胚胎移植(IVF-ET)或胞浆内单精子注射(ICSI)的妊娠率无相关性。目前越来越多的研究认为抗精子抗体对妊娠率无明显影响，因此其对临床指导意义并不大。而对于抗卵巢抗体和抗子宫内膜抗体对生殖的影响目前尚无大样本的荟萃分析，多数都是小样本的观察性研究，证据等级并不高。研究发现，甲状腺功能正常的妇女，无论是否存在抗甲状腺抗体，其临床妊娠率相似。因此，单纯抗甲状腺抗体阳性似乎与妊娠率关系并不大，对于抗甲状腺抗体阳性患者还应密切监测其甲状腺功能。
抗磷脂抗体抗磷脂抗体主要与血栓形成和妊娠并发症有关，目前对于抗磷脂抗体的研究越来越多，普遍认为抗磷脂抗体阳性可能导致流产的发生，至于抗磷脂抗体能否导致不孕仍需大样本的前瞻性实验进一步研究证实。
抗核抗体ANA对妊娠的影响研究结果不一，研究表明，ANA可对卵母细胞和胚胎的发育产生不利影响，导致妊娠和着床率降低。研究表明，ANA与首次接受IVF/ICSI治疗的妇女的妊娠结局无关。因此，ANA是否影响妊娠仍存在一定的争议。
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